本发明目的在于提供一种氢燃料电池电堆磁流体密封装置，用于金属双极板氢燃料电池单元的静密封。包括阳极板1、阴极板2、磁流体胶条3和永磁体4。本发明可以有效解决氢燃料电池电堆分层结构中密封线长度较大，一般采用橡塑密封方案时容易导致细微的渗漏进而导致密封失败的问题。且橡塑密封主要靠粘贴或结构挤压，需要恰当的力和结构实现密封要求，对装配及加工工艺要求较高。本发明是在电池单元内部MEA两面的边缘设计环状空间并放入含有磁性液体的磁流体胶条，磁流体胶条外侧和双极板内侧设置卡槽放置永磁体，利用永磁体产生磁场对含磁性液体橡胶条形成自然的无源约束，从而实现电池单元内部氢气和氧气的有效密封。